Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCH4

CYP4A22, Cytochrome P450 4A22, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A22Q5TCH4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP4A22Q5TCH4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP4A22Q5TCH4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP4A22Q5TCH4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP4A22Q5TCH4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP4A22Q5TCH4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP4A22Q5TCH4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP4A22Q5TCH4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP4A22Q5TCH4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP4A22Q5TCH4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP4A22Q5TCH4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP4A22Q5TCH4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP4A22Q5TCH4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP4A22Q5TCH4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP4A22Q5TCH4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP4A22Q5TCH4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP4A22Q5TCH4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP4A22Q5TCH4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP4A22Q5TCH4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP4A22Q5TCH4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP4A22Q5TCH4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP4A22Q5TCH4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP4A22Q5TCH4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP4A22Q5TCH4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYP4A22Q5TCH4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP4A22Q5TCH4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP4A22Q5TCH4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP4A22Q5TCH4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP4A22Q5TCH4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP4A22Q5TCH4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP4A22Q5TCH4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP4A22Q5TCH4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP4A22Q5TCH4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP4A22Q5TCH4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP4A22Q5TCH4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP4A22Q5TCH4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP4A22Q5TCH4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP4A22Q5TCH4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP4A22Q5TCH4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP4A22Q5TCH4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP4A22Q5TCH4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP4A22Q5TCH4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP4A22Q5TCH4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP4A22Q5TCH4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP4A22Q5TCH4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP4A22Q5TCH4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP4A22Q5TCH4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms