Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC92Q53HC0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC92Q53HC0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC92Q53HC0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC92Q53HC0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC92Q53HC0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC92Q53HC0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC92Q53HC0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC92Q53HC0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC92Q53HC0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC92Q53HC0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC92Q53HC0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC92Q53HC0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC92Q53HC0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC92Q53HC0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC92Q53HC0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC92Q53HC0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC92Q53HC0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC92Q53HC0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC92Q53HC0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms