Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP13-3Q3SY46 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP13-3Q3SY46 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP13-3Q3SY46 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP13-3Q3SY46 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP13-3Q3SY46 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP13-3Q3SY46 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP13-3Q3SY46 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP13-3Q3SY46 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP13-3Q3SY46 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KRTAP13-3Q3SY46 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KRTAP13-3Q3SY46 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP13-3Q3SY46 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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