Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSNAXIP1Q2TAA8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSNAXIP1Q2TAA8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSNAXIP1Q2TAA8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSNAXIP1Q2TAA8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSNAXIP1Q2TAA8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSNAXIP1Q2TAA8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSNAXIP1Q2TAA8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSNAXIP1Q2TAA8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TSNAXIP1Q2TAA8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSNAXIP1Q2TAA8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSNAXIP1Q2TAA8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSNAXIP1Q2TAA8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSNAXIP1Q2TAA8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSNAXIP1Q2TAA8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSNAXIP1Q2TAA8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSNAXIP1Q2TAA8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSNAXIP1Q2TAA8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSNAXIP1Q2TAA8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSNAXIP1Q2TAA8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSNAXIP1Q2TAA8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSNAXIP1Q2TAA8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms