Protein–RNA interactions for Protein: Q15846

CLUL1, Clusterin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUL1Q15846 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLUL1Q15846 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLUL1Q15846 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLUL1Q15846 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLUL1Q15846 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLUL1Q15846 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLUL1Q15846 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLUL1Q15846 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLUL1Q15846 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLUL1Q15846 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLUL1Q15846 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLUL1Q15846 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLUL1Q15846 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLUL1Q15846 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLUL1Q15846 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLUL1Q15846 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLUL1Q15846 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLUL1Q15846 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLUL1Q15846 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLUL1Q15846 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLUL1Q15846 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLUL1Q15846 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLUL1Q15846 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLUL1Q15846 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLUL1Q15846 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLUL1Q15846 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLUL1Q15846 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLUL1Q15846 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CLUL1Q15846 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLUL1Q15846 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLUL1Q15846 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUL1Q15846 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLUL1Q15846 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLUL1Q15846 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUL1Q15846 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUL1Q15846 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUL1Q15846 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUL1Q15846 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUL1Q15846 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLUL1Q15846 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CLUL1Q15846 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLUL1Q15846 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLUL1Q15846 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLUL1Q15846 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLUL1Q15846 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLUL1Q15846 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLUL1Q15846 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLUL1Q15846 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLUL1Q15846 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLUL1Q15846 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLUL1Q15846 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLUL1Q15846 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLUL1Q15846 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLUL1Q15846 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
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