Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RAB3GAP1Q15042 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RAB3GAP1Q15042 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RAB3GAP1Q15042 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RAB3GAP1Q15042 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAB3GAP1Q15042 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RAB3GAP1Q15042 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RAB3GAP1Q15042 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RAB3GAP1Q15042 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RAB3GAP1Q15042 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RAB3GAP1Q15042 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RAB3GAP1Q15042 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RAB3GAP1Q15042 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RAB3GAP1Q15042 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RAB3GAP1Q15042 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RAB3GAP1Q15042 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RAB3GAP1Q15042 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RAB3GAP1Q15042 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RAB3GAP1Q15042 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RAB3GAP1Q15042 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RAB3GAP1Q15042 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RAB3GAP1Q15042 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RAB3GAP1Q15042 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
RAB3GAP1Q15042 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RAB3GAP1Q15042 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RAB3GAP1Q15042 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RAB3GAP1Q15042 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAB3GAP1Q15042 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAB3GAP1Q15042 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAB3GAP1Q15042 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAB3GAP1Q15042 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAB3GAP1Q15042 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RAB3GAP1Q15042 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RAB3GAP1Q15042 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RAB3GAP1Q15042 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RAB3GAP1Q15042 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RAB3GAP1Q15042 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RAB3GAP1Q15042 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RAB3GAP1Q15042 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RAB3GAP1Q15042 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RAB3GAP1Q15042 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RAB3GAP1Q15042 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RAB3GAP1Q15042 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RAB3GAP1Q15042 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RAB3GAP1Q15042 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAB3GAP1Q15042 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAB3GAP1Q15042 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
RAB3GAP1Q15042 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAB3GAP1Q15042 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAB3GAP1Q15042 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RAB3GAP1Q15042 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RAB3GAP1Q15042 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RAB3GAP1Q15042 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RAB3GAP1Q15042 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RAB3GAP1Q15042 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RAB3GAP1Q15042 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RAB3GAP1Q15042 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RAB3GAP1Q15042 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RAB3GAP1Q15042 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RAB3GAP1Q15042 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RAB3GAP1Q15042 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RAB3GAP1Q15042 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RAB3GAP1Q15042 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
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