Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKAA1Q13131 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKAA1Q13131 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKAA1Q13131 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRKAA1Q13131 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKAA1Q13131 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKAA1Q13131 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAA1Q13131 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAA1Q13131 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAA1Q13131 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAA1Q13131 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAA1Q13131 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAA1Q13131 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKAA1Q13131 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAA1Q13131 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAA1Q13131 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAA1Q13131 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKAA1Q13131 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAA1Q13131 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRKAA1Q13131 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAA1Q13131 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAA1Q13131 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKAA1Q13131 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKAA1Q13131 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAA1Q13131 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAA1Q13131 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKAA1Q13131 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKAA1Q13131 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKAA1Q13131 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAA1Q13131 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAA1Q13131 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAA1Q13131 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAA1Q13131 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAA1Q13131 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAA1Q13131 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAA1Q13131 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAA1Q13131 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAA1Q13131 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAA1Q13131 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAA1Q13131 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAA1Q13131 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAA1Q13131 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAA1Q13131 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
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