Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRKAA1Q13131 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRKAA1Q13131 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRKAA1Q13131 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRKAA1Q13131 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRKAA1Q13131 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRKAA1Q13131 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRKAA1Q13131 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRKAA1Q13131 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRKAA1Q13131 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PRKAA1Q13131 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRKAA1Q13131 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRKAA1Q13131 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRKAA1Q13131 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRKAA1Q13131 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKAA1Q13131 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRKAA1Q13131 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRKAA1Q13131 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRKAA1Q13131 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKAA1Q13131 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKAA1Q13131 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRKAA1Q13131 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRKAA1Q13131 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRKAA1Q13131 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRKAA1Q13131 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRKAA1Q13131 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRKAA1Q13131 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRKAA1Q13131 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRKAA1Q13131 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRKAA1Q13131 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRKAA1Q13131 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRKAA1Q13131 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRKAA1Q13131 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRKAA1Q13131 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRKAA1Q13131 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRKAA1Q13131 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRKAA1Q13131 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRKAA1Q13131 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRKAA1Q13131 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRKAA1Q13131 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKAA1Q13131 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRKAA1Q13131 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKAA1Q13131 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKAA1Q13131 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKAA1Q13131 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKAA1Q13131 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKAA1Q13131 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKAA1Q13131 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKAA1Q13131 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKAA1Q13131 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKAA1Q13131 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKAA1Q13131 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKAA1Q13131 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKAA1Q13131 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKAA1Q13131 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKAA1Q13131 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKAA1Q13131 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKAA1Q13131 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKAA1Q13131 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKAA1Q13131 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKAA1Q13131 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKAA1Q13131 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKAA1Q13131 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKAA1Q13131 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKAA1Q13131 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKAA1Q13131 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKAA1Q13131 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKAA1Q13131 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKAA1Q13131 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKAA1Q13131 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKAA1Q13131 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAA1Q13131 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKAA1Q13131 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAA1Q13131 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAA1Q13131 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKAA1Q13131 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKAA1Q13131 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKAA1Q13131 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKAA1Q13131 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKAA1Q13131 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKAA1Q13131 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKAA1Q13131 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKAA1Q13131 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKAA1Q13131 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKAA1Q13131 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRKAA1Q13131 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKAA1Q13131 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKAA1Q13131 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKAA1Q13131 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKAA1Q13131 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKAA1Q13131 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKAA1Q13131 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKAA1Q13131 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKAA1Q13131 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKAA1Q13131 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKAA1Q13131 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKAA1Q13131 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKAA1Q13131 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKAA1Q13131 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKAA1Q13131 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
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