Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 LEMD2-209ENST00000511171 4870 ntTSL 212.29□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 27.5
GRSF1Q12849 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.265e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.235e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.25e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.195e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.075e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.035e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.845e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.825e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.735e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 PLXNB1-211ENST00000470525 835 ntTSL 518.66■□□□□ 0.585e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.525e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.515e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 NAB2-203ENST00000554718 791 ntTSL 518.08■□□□□ 0.485e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.066e-10■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.066e-10■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.045e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 PSMB6-202ENST00000571309 583 ntTSL 314.74□□□□□ -0.056e-10■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.145e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 PSMB6-204ENST00000575643 666 ntTSL 214.08□□□□□ -0.166e-10■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 PLXNB1-218ENST00000485535 3264 ntTSL 212.26□□□□□ -0.455e-8■■■■■ 27.4
GRSF1Q12849 SNHG7-202ENST00000416970 789 ntTSL 1 (best)24.5■■□□□ 1.513e-13■■■■■ 27.3
GRSF1Q12849 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.323e-13■■■■■ 27.3
GRSF1Q12849 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.063e-13■■■■■ 27.3
GRSF1Q12849 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.162e-10■■■■■ 27.3
GRSF1Q12849 RAP2A-202ENST00000476869 903 ntTSL 315.78■□□□□ 0.122e-10■■■■■ 27.3
GRSF1Q12849 FAM83H-202ENST00000395103 3611 ntTSL 215.4■□□□□ 0.066e-7■■■■■ 27.1
GRSF1Q12849 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.193e-8■■■■■ 27.1
GRSF1Q12849 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -03e-8■■■■■ 27.1
GRSF1Q12849 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 27.1
GRSF1Q12849 TRIR-204ENST00000591254 988 ntTSL 227.34■■□□□ 1.978e-13■■■■■ 27
GRSF1Q12849 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.648e-13■■■■■ 27
GRSF1Q12849 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.488e-13■■■■■ 27
GRSF1Q12849 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.328e-13■■■■■ 27
GRSF1Q12849 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.128e-8■■■■■ 26.9
GRSF1Q12849 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.988e-8■■■■■ 26.9
GRSF1Q12849 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 26.8
GRSF1Q12849 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 26.8
GRSF1Q12849 ARHGAP26-214ENST00000469131 667 ntTSL 312.01□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 26.8
GRSF1Q12849 ARHGAP26-215ENST00000469396 513 ntTSL 512□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 26.8
GRSF1Q12849 ARHGAP26-211ENST00000451259 527 ntTSL 510.28□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 26.8
GRSF1Q12849 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 26.8
GRSF1Q12849 PLCXD1-206ENST00000430923 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.37■□□□□ 0.212e-7■■■■□ 26.7
GRSF1Q12849 PLCXD1-211ENST00000484611 540 ntTSL 415.85■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 26.7
GRSF1Q12849 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.482e-7■■■■□ 26.7
GRSF1Q12849 NOP9-203ENST00000557362 455 ntTSL 518.02■□□□□ 0.482e-11■■■■□ 26.6
GRSF1Q12849 AFF3-211ENST00000440445 591 ntTSL 428.41■■■□□ 2.149e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 AFF3-212ENST00000441400 543 ntTSL 428.41■■■□□ 2.149e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 ZSCAN29-203ENST00000561661 643 ntTSL 327.7■■■□□ 2.029e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.979e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 PRKAR1B-202ENST00000400758 888 ntTSL 326.63■■□□□ 1.859e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 SDF2L1-202ENST00000466935 601 ntTSL 226.62■■□□□ 1.859e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.689e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.349e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 AFF3-210ENST00000432037 559 ntTSL 422.85■■□□□ 1.259e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.039e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.659e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 AFF3-204ENST00000415384 574 ntTSL 419.08■□□□□ 0.649e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 ZSCAN29-205ENST00000563508 701 ntTSL 318.33■□□□□ 0.529e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 PRKAR1B-207ENST00000430040 1006 ntTSL 317.82■□□□□ 0.449e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.439e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.419e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 AFF3-207ENST00000424600 551 ntTSL 416.49■□□□□ 0.239e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 AFF3-205ENST00000416492 545 ntTSL 415.7■□□□□ 0.19e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.089e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.129e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.239e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 AFF3-206ENST00000423966 702 ntTSL 29.59□□□□□ -0.879e-8■■■■□ 26.5
GRSF1Q12849 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.931e-17■■■■□ 26.2
GRSF1Q12849 ERMP1-205ENST00000487088 2799 ntTSL 521.12■□□□□ 0.977e-12■■■■□ 26.2
GRSF1Q12849 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 26
GRSF1Q12849 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.167e-7■■■■□ 25.9
GRSF1Q12849 SS18L1-205ENST00000492466 899 ntTSL 515.52■□□□□ 0.087e-7■■■■□ 25.9
GRSF1Q12849 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.927e-7■■■■□ 25.9
GRSF1Q12849 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.141e-10■■■■□ 25.9
GRSF1Q12849 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.423e-7■■■■□ 25.9
GRSF1Q12849 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.982e-7■■■■□ 25.7
GRSF1Q12849 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.852e-7■■■■□ 25.7
GRSF1Q12849 ABHD17A-206ENST00000592757 740 ntTSL 320.82■□□□□ 0.922e-7■■■■□ 25.7
GRSF1Q12849 ABHD17A-203ENST00000588598 5425 ntTSL 219.24■□□□□ 0.672e-7■■■■□ 25.7
GRSF1Q12849 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.642e-7■■■■□ 25.7
GRSF1Q12849 ABHD17A-205ENST00000591351 4647 ntTSL 217.25■□□□□ 0.352e-7■■■■□ 25.7
GRSF1Q12849 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 516.76■□□□□ 0.272e-7■■■■□ 25.7
GRSF1Q12849 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 413.87□□□□□ -0.192e-7■■■■□ 25.7
GRSF1Q12849 ERO1A-206ENST00000556039 1855 ntTSL 529.53■■■□□ 2.323e-10■■■■□ 25.6
GRSF1Q12849 ERO1A-203ENST00000554019 2094 ntTSL 527.1■■□□□ 1.933e-10■■■■□ 25.6
GRSF1Q12849 SURF1-203ENST00000463965 493 ntTSL 327.36■■□□□ 1.974e-7■■■■□ 25.6
GRSF1Q12849 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.844e-7■■■■□ 25.6
GRSF1Q12849 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.844e-7■■■■□ 25.6
GRSF1Q12849 SURF1-202ENST00000437995 813 ntTSL 520.5■□□□□ 0.874e-7■■■■□ 25.6
GRSF1Q12849 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.44e-7■■■■□ 25.6
GRSF1Q12849 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.424e-7■■■■□ 25.6
GRSF1Q12849 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.267e-20■■■■□ 25.5
GRSF1Q12849 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.677e-20■■■■□ 25.5
GRSF1Q12849 PPP1CC-211ENST00000620030 582 ntTSL 225.01■■□□□ 1.597e-20■■■■□ 25.5
GRSF1Q12849 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.437e-20■■■■□ 25.5
GRSF1Q12849 PPP1CC-209ENST00000551690 603 ntTSL 323.22■■□□□ 1.317e-20■■■■□ 25.5
GRSF1Q12849 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.867e-20■■■■□ 25.5
GRSF1Q12849 COL9A3-210ENST00000472880 959 ntTSL 321.15■□□□□ 0.983e-8■■■■□ 25.4
GRSF1Q12849 PUS1-206ENST00000537484 642 ntTSL 320.75■□□□□ 0.912e-20■■■■□ 25.4
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