RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441400.5

AFF3-212, Transcript of AF4/FMR2 family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene AFF3, Length 543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF3-212ENST00000441400 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.34■■■■■ 8.21
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AFF3-212ENST00000441400 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.52■■■■■ 5.36
AFF3-212ENST00000441400 IFT140Q96RY7 1462 aa48.49■■■■■ 5.35
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AFF3-212ENST00000441400 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.48■■■■■ 5.19
AFF3-212ENST00000441400 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.48■■■■■ 5.19
AFF3-212ENST00000441400 GRIN2BQ13224 1484 aa47.47■■■■■ 5.19
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AFF3-212ENST00000441400 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.39■■■■■ 5.18
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AFF3-212ENST00000441400 PBRM1Q86U86 1689 aa47.35■■■■■ 5.17
AFF3-212ENST00000441400 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.35■■■■■ 5.17
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AFF3-212ENST00000441400 SYNJ2O15056 1496 aa47.26■■■■■ 5.16
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AFF3-212ENST00000441400 CEP170Q5SW79 1584 aa46.66■■■■■ 5.06
AFF3-212ENST00000441400 SHROOM2Q13796 1616 aa46.47■■■■■ 5.03
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AFF3-212ENST00000441400 IGF1RP08069 1367 aa46.35■■■■■ 5.01
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AFF3-212ENST00000441400 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.27■■■■■ 5
AFF3-212ENST00000441400 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.17■■■■■ 4.98
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