Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC15Q0P6D6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC15Q0P6D6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC15Q0P6D6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC15Q0P6D6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC15Q0P6D6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC15Q0P6D6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC15Q0P6D6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC15Q0P6D6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC15Q0P6D6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC15Q0P6D6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC15Q0P6D6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC15Q0P6D6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC15Q0P6D6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC15Q0P6D6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC15Q0P6D6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC15Q0P6D6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC15Q0P6D6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC15Q0P6D6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms