Protein–RNA interactions for Protein: Q04756

HGFAC, Hepatocyte growth factor activator, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGFACQ04756 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HGFACQ04756 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HGFACQ04756 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HGFACQ04756 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HGFACQ04756 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HGFACQ04756 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HGFACQ04756 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HGFACQ04756 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HGFACQ04756 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HGFACQ04756 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HGFACQ04756 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HGFACQ04756 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HGFACQ04756 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HGFACQ04756 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HGFACQ04756 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HGFACQ04756 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGFACQ04756 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms