Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MC1RQ01726 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MC1RQ01726 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MC1RQ01726 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MC1RQ01726 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MC1RQ01726 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MC1RQ01726 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MC1RQ01726 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MC1RQ01726 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MC1RQ01726 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MC1RQ01726 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MC1RQ01726 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MC1RQ01726 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MC1RQ01726 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MC1RQ01726 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MC1RQ01726 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MC1RQ01726 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MC1RQ01726 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MC1RQ01726 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MC1RQ01726 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MC1RQ01726 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MC1RQ01726 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MC1RQ01726 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MC1RQ01726 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MC1RQ01726 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MC1RQ01726 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MC1RQ01726 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MC1RQ01726 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MC1RQ01726 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MC1RQ01726 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms