Protein–RNA interactions for Protein: P61086

UBE2K, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2KP61086 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2KP61086 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2KP61086 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2KP61086 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2KP61086 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2KP61086 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2KP61086 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2KP61086 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 301.2 ms