Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRLP54845 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRLP54845 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRLP54845 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRLP54845 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRLP54845 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRLP54845 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRLP54845 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRLP54845 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRLP54845 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRLP54845 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRLP54845 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRLP54845 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRLP54845 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRLP54845 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRLP54845 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRLP54845 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRLP54845 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRLP54845 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRLP54845 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRLP54845 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRLP54845 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NRLP54845 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NRLP54845 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRLP54845 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRLP54845 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NRLP54845 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRLP54845 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRLP54845 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRLP54845 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRLP54845 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRLP54845 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRLP54845 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRLP54845 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRLP54845 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRLP54845 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRLP54845 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRLP54845 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRLP54845 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRLP54845 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRLP54845 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRLP54845 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRLP54845 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRLP54845 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRLP54845 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NRLP54845 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRLP54845 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRLP54845 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRLP54845 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRLP54845 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRLP54845 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRLP54845 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRLP54845 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRLP54845 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NRLP54845 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NRLP54845 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NRLP54845 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NRLP54845 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NRLP54845 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NRLP54845 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NRLP54845 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NRLP54845 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NRLP54845 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NRLP54845 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NRLP54845 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NRLP54845 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NRLP54845 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NRLP54845 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NRLP54845 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRLP54845 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRLP54845 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRLP54845 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NRLP54845 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRLP54845 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRLP54845 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRLP54845 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRLP54845 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRLP54845 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRLP54845 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NRLP54845 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRLP54845 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRLP54845 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRLP54845 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRLP54845 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRLP54845 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRLP54845 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRLP54845 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRLP54845 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRLP54845 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRLP54845 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRLP54845 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NRLP54845 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRLP54845 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRLP54845 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRLP54845 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRLP54845 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRLP54845 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRLP54845 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRLP54845 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRLP54845 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms