Protein–RNA interactions for Protein: P53004

BLVRA, Biliverdin reductase A, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLVRAP53004 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BLVRAP53004 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BLVRAP53004 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BLVRAP53004 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BLVRAP53004 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BLVRAP53004 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BLVRAP53004 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BLVRAP53004 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BLVRAP53004 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BLVRAP53004 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLVRAP53004 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BLVRAP53004 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms