Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHRNA3P32297 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA3P32297 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA3P32297 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA3P32297 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA3P32297 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA3P32297 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA3P32297 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA3P32297 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA3P32297 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA3P32297 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA3P32297 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA3P32297 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA3P32297 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA3P32297 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA3P32297 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHRNA3P32297 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA3P32297 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA3P32297 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA3P32297 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA3P32297 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA3P32297 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA3P32297 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA3P32297 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA3P32297 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA3P32297 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA3P32297 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA3P32297 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNA3P32297 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNA3P32297 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA3P32297 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHRNA3P32297 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA3P32297 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA3P32297 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA3P32297 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA3P32297 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA3P32297 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA3P32297 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms