Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPOP30536 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPOP30536 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPOP30536 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPOP30536 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPOP30536 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPOP30536 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPOP30536 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPOP30536 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPOP30536 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPOP30536 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPOP30536 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPOP30536 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPOP30536 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPOP30536 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPOP30536 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPOP30536 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPOP30536 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPOP30536 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPOP30536 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPOP30536 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPOP30536 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPOP30536 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPOP30536 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPOP30536 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPOP30536 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPOP30536 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPOP30536 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPOP30536 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPOP30536 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSPOP30536 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPOP30536 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPOP30536 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPOP30536 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPOP30536 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPOP30536 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPOP30536 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPOP30536 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPOP30536 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPOP30536 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPOP30536 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPOP30536 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPOP30536 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPOP30536 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPOP30536 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPOP30536 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPOP30536 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPOP30536 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPOP30536 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPOP30536 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPOP30536 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPOP30536 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPOP30536 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPOP30536 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSPOP30536 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSPOP30536 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSPOP30536 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPOP30536 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPOP30536 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPOP30536 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPOP30536 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPOP30536 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPOP30536 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPOP30536 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPOP30536 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPOP30536 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPOP30536 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPOP30536 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPOP30536 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPOP30536 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPOP30536 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPOP30536 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPOP30536 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPOP30536 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPOP30536 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPOP30536 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPOP30536 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPOP30536 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSPOP30536 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSPOP30536 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSPOP30536 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSPOP30536 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSPOP30536 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSPOP30536 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSPOP30536 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSPOP30536 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSPOP30536 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSPOP30536 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSPOP30536 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TSPOP30536 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSPOP30536 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSPOP30536 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSPOP30536 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TSPOP30536 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSPOP30536 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSPOP30536 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TSPOP30536 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSPOP30536 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TSPOP30536 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSPOP30536 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms