Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD53P19397 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD53P19397 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD53P19397 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD53P19397 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD53P19397 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD53P19397 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD53P19397 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD53P19397 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD53P19397 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD53P19397 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD53P19397 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD53P19397 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD53P19397 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD53P19397 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD53P19397 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD53P19397 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD53P19397 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD53P19397 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD53P19397 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD53P19397 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CD53P19397 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD53P19397 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD53P19397 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD53P19397 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD53P19397 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD53P19397 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD53P19397 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD53P19397 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD53P19397 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD53P19397 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD53P19397 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CD53P19397 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD53P19397 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD53P19397 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD53P19397 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD53P19397 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD53P19397 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD53P19397 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD53P19397 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CD53P19397 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD53P19397 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD53P19397 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD53P19397 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD53P19397 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD53P19397 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD53P19397 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD53P19397 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD53P19397 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD53P19397 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD53P19397 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD53P19397 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD53P19397 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD53P19397 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD53P19397 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD53P19397 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD53P19397 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD53P19397 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CD53P19397 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD53P19397 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CD53P19397 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD53P19397 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD53P19397 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CD53P19397 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD53P19397 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD53P19397 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD53P19397 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD53P19397 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD53P19397 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD53P19397 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD53P19397 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD53P19397 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD53P19397 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD53P19397 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD53P19397 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CD53P19397 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD53P19397 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD53P19397 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD53P19397 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CD53P19397 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD53P19397 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD53P19397 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD53P19397 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD53P19397 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD53P19397 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CD53P19397 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD53P19397 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD53P19397 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD53P19397 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD53P19397 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD53P19397 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD53P19397 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD53P19397 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD53P19397 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD53P19397 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CD53P19397 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD53P19397 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD53P19397 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD53P19397 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD53P19397 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms