Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPGDP15428 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPGDP15428 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPGDP15428 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPGDP15428 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPGDP15428 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPGDP15428 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPGDP15428 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPGDP15428 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPGDP15428 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPGDP15428 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPGDP15428 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPGDP15428 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPGDP15428 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPGDP15428 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPGDP15428 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPGDP15428 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPGDP15428 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPGDP15428 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPGDP15428 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPGDP15428 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPGDP15428 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPGDP15428 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPGDP15428 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPGDP15428 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPGDP15428 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPGDP15428 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPGDP15428 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPGDP15428 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPGDP15428 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPGDP15428 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPGDP15428 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPGDP15428 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPGDP15428 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPGDP15428 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPGDP15428 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPGDP15428 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPGDP15428 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPGDP15428 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPGDP15428 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HPGDP15428 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPGDP15428 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPGDP15428 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPGDP15428 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HPGDP15428 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPGDP15428 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPGDP15428 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPGDP15428 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPGDP15428 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPGDP15428 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPGDP15428 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPGDP15428 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPGDP15428 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPGDP15428 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPGDP15428 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPGDP15428 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HPGDP15428 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPGDP15428 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPGDP15428 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPGDP15428 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPGDP15428 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HPGDP15428 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPGDP15428 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPGDP15428 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HPGDP15428 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPGDP15428 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPGDP15428 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPGDP15428 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPGDP15428 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HPGDP15428 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPGDP15428 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPGDP15428 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPGDP15428 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPGDP15428 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HPGDP15428 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPGDP15428 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPGDP15428 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPGDP15428 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPGDP15428 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPGDP15428 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HPGDP15428 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPGDP15428 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPGDP15428 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPGDP15428 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPGDP15428 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPGDP15428 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPGDP15428 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPGDP15428 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HPGDP15428 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPGDP15428 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPGDP15428 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPGDP15428 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPGDP15428 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPGDP15428 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPGDP15428 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPGDP15428 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPGDP15428 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPGDP15428 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPGDP15428 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPGDP15428 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms