Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HPGDP15428 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HPGDP15428 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HPGDP15428 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
HPGDP15428 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HPGDP15428 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HPGDP15428 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HPGDP15428 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HPGDP15428 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HPGDP15428 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HPGDP15428 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HPGDP15428 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HPGDP15428 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HPGDP15428 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HPGDP15428 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HPGDP15428 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HPGDP15428 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HPGDP15428 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HPGDP15428 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HPGDP15428 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HPGDP15428 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HPGDP15428 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HPGDP15428 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HPGDP15428 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HPGDP15428 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPGDP15428 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPGDP15428 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPGDP15428 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HPGDP15428 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HPGDP15428 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HPGDP15428 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HPGDP15428 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPGDP15428 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HPGDP15428 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPGDP15428 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPGDP15428 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPGDP15428 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPGDP15428 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HPGDP15428 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPGDP15428 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPGDP15428 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPGDP15428 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPGDP15428 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPGDP15428 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPGDP15428 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPGDP15428 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPGDP15428 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPGDP15428 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPGDP15428 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPGDP15428 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HPGDP15428 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPGDP15428 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPGDP15428 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPGDP15428 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HPGDP15428 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HPGDP15428 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
HPGDP15428 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPGDP15428 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPGDP15428 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HPGDP15428 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPGDP15428 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPGDP15428 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPGDP15428 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HPGDP15428 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPGDP15428 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPGDP15428 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPGDP15428 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPGDP15428 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPGDP15428 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPGDP15428 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPGDP15428 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HPGDP15428 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPGDP15428 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPGDP15428 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPGDP15428 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPGDP15428 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPGDP15428 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPGDP15428 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPGDP15428 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPGDP15428 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPGDP15428 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HPGDP15428 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPGDP15428 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPGDP15428 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPGDP15428 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HPGDP15428 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPGDP15428 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPGDP15428 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPGDP15428 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPGDP15428 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPGDP15428 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPGDP15428 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HPGDP15428 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HPGDP15428 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPGDP15428 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPGDP15428 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HPGDP15428 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPGDP15428 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPGDP15428 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPGDP15428 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms