Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRF1P14222 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRF1P14222 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRF1P14222 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRF1P14222 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRF1P14222 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRF1P14222 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRF1P14222 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRF1P14222 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRF1P14222 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRF1P14222 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRF1P14222 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRF1P14222 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRF1P14222 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRF1P14222 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRF1P14222 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRF1P14222 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRF1P14222 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRF1P14222 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRF1P14222 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRF1P14222 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRF1P14222 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRF1P14222 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRF1P14222 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRF1P14222 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRF1P14222 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRF1P14222 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRF1P14222 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRF1P14222 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRF1P14222 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRF1P14222 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRF1P14222 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRF1P14222 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRF1P14222 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRF1P14222 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRF1P14222 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRF1P14222 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRF1P14222 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRF1P14222 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRF1P14222 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRF1P14222 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRF1P14222 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRF1P14222 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRF1P14222 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRF1P14222 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRF1P14222 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRF1P14222 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRF1P14222 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRF1P14222 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRF1P14222 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRF1P14222 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRF1P14222 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRF1P14222 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRF1P14222 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRF1P14222 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRF1P14222 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRF1P14222 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRF1P14222 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRF1P14222 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRF1P14222 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRF1P14222 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRF1P14222 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRF1P14222 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRF1P14222 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRF1P14222 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRF1P14222 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRF1P14222 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRF1P14222 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRF1P14222 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRF1P14222 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRF1P14222 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRF1P14222 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRF1P14222 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRF1P14222 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRF1P14222 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRF1P14222 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRF1P14222 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRF1P14222 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRF1P14222 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRF1P14222 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRF1P14222 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRF1P14222 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRF1P14222 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRF1P14222 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRF1P14222 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRF1P14222 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRF1P14222 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRF1P14222 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRF1P14222 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRF1P14222 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRF1P14222 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRF1P14222 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRF1P14222 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRF1P14222 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRF1P14222 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRF1P14222 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRF1P14222 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRF1P14222 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRF1P14222 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRF1P14222 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms