Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OPN1MW3P0DN78 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN1MW3P0DN78 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OPN1MW3P0DN78 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
OPN1MW3P0DN78 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms