Protein–RNA interactions for Protein: P05814

CSN2, Beta-casein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN2P05814 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSN2P05814 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSN2P05814 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSN2P05814 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSN2P05814 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSN2P05814 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSN2P05814 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSN2P05814 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSN2P05814 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSN2P05814 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSN2P05814 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSN2P05814 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSN2P05814 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSN2P05814 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSN2P05814 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSN2P05814 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSN2P05814 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSN2P05814 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSN2P05814 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSN2P05814 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSN2P05814 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSN2P05814 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSN2P05814 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSN2P05814 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSN2P05814 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSN2P05814 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSN2P05814 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSN2P05814 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSN2P05814 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CSN2P05814 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CSN2P05814 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CSN2P05814 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSN2P05814 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSN2P05814 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSN2P05814 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSN2P05814 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSN2P05814 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSN2P05814 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSN2P05814 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSN2P05814 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSN2P05814 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSN2P05814 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSN2P05814 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSN2P05814 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSN2P05814 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSN2P05814 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSN2P05814 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSN2P05814 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSN2P05814 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSN2P05814 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSN2P05814 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSN2P05814 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSN2P05814 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSN2P05814 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSN2P05814 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSN2P05814 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSN2P05814 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSN2P05814 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSN2P05814 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSN2P05814 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSN2P05814 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSN2P05814 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSN2P05814 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSN2P05814 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSN2P05814 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSN2P05814 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSN2P05814 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSN2P05814 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSN2P05814 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSN2P05814 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSN2P05814 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSN2P05814 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSN2P05814 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSN2P05814 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSN2P05814 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSN2P05814 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSN2P05814 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSN2P05814 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSN2P05814 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSN2P05814 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSN2P05814 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSN2P05814 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSN2P05814 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSN2P05814 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSN2P05814 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSN2P05814 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSN2P05814 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSN2P05814 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSN2P05814 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSN2P05814 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSN2P05814 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSN2P05814 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSN2P05814 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSN2P05814 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSN2P05814 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSN2P05814 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSN2P05814 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSN2P05814 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSN2P05814 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSN2P05814 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms