Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1P04632 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1P04632 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1P04632 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1P04632 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1P04632 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1P04632 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1P04632 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1P04632 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1P04632 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1P04632 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1P04632 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1P04632 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1P04632 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1P04632 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1P04632 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1P04632 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1P04632 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1P04632 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1P04632 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1P04632 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1P04632 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1P04632 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1P04632 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1P04632 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1P04632 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1P04632 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1P04632 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1P04632 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms