Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIF4AO95239 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIF4AO95239 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIF4AO95239 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIF4AO95239 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF4AO95239 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF4AO95239 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
KIF4AO95239 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KIF4AO95239 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIF4AO95239 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIF4AO95239 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIF4AO95239 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIF4AO95239 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIF4AO95239 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIF4AO95239 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KIF4AO95239 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIF4AO95239 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIF4AO95239 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIF4AO95239 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIF4AO95239 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIF4AO95239 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIF4AO95239 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIF4AO95239 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIF4AO95239 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KIF4AO95239 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KIF4AO95239 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KIF4AO95239 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIF4AO95239 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIF4AO95239 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIF4AO95239 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIF4AO95239 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIF4AO95239 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIF4AO95239 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIF4AO95239 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIF4AO95239 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KIF4AO95239 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KIF4AO95239 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KIF4AO95239 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIF4AO95239 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF4AO95239 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIF4AO95239 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KIF4AO95239 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIF4AO95239 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIF4AO95239 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIF4AO95239 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF4AO95239 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF4AO95239 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF4AO95239 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF4AO95239 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF4AO95239 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF4AO95239 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms