Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM24O75264 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM24O75264 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM24O75264 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM24O75264 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM24O75264 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM24O75264 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms