Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATP8B3O60423 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP8B3O60423 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP8B3O60423 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP8B3O60423 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP8B3O60423 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP8B3O60423 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP8B3O60423 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP8B3O60423 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP8B3O60423 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP8B3O60423 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP8B3O60423 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP8B3O60423 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP8B3O60423 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP8B3O60423 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP8B3O60423 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP8B3O60423 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP8B3O60423 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP8B3O60423 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP8B3O60423 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP8B3O60423 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP8B3O60423 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP8B3O60423 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B3O60423 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B3O60423 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B3O60423 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATP8B3O60423 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP8B3O60423 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms