Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRXO43186 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRXO43186 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRXO43186 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRXO43186 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRXO43186 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRXO43186 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRXO43186 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRXO43186 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRXO43186 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRXO43186 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRXO43186 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRXO43186 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRXO43186 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRXO43186 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRXO43186 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRXO43186 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRXO43186 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRXO43186 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRXO43186 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRXO43186 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRXO43186 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRXO43186 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRXO43186 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRXO43186 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRXO43186 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRXO43186 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRXO43186 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRXO43186 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRXO43186 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRXO43186 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRXO43186 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRXO43186 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRXO43186 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRXO43186 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRXO43186 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRXO43186 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRXO43186 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRXO43186 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRXO43186 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRXO43186 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRXO43186 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRXO43186 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRXO43186 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRXO43186 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRXO43186 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRXO43186 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRXO43186 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRXO43186 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRXO43186 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRXO43186 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRXO43186 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRXO43186 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRXO43186 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRXO43186 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRXO43186 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CRXO43186 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRXO43186 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRXO43186 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRXO43186 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRXO43186 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRXO43186 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CRXO43186 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRXO43186 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CRXO43186 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRXO43186 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRXO43186 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRXO43186 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRXO43186 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRXO43186 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRXO43186 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRXO43186 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CRXO43186 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRXO43186 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRXO43186 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRXO43186 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRXO43186 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRXO43186 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRXO43186 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRXO43186 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CRXO43186 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CRXO43186 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CRXO43186 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CRXO43186 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CRXO43186 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CRXO43186 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CRXO43186 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CRXO43186 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CRXO43186 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CRXO43186 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CRXO43186 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CRXO43186 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CRXO43186 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CRXO43186 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CRXO43186 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CRXO43186 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CRXO43186 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CRXO43186 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CRXO43186 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CRXO43186 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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