Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
N4BP3O15049 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
N4BP3O15049 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
N4BP3O15049 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
N4BP3O15049 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
N4BP3O15049 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
N4BP3O15049 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
N4BP3O15049 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
N4BP3O15049 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
N4BP3O15049 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
N4BP3O15049 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
N4BP3O15049 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
N4BP3O15049 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
N4BP3O15049 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
N4BP3O15049 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
N4BP3O15049 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
N4BP3O15049 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
N4BP3O15049 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
N4BP3O15049 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
N4BP3O15049 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
N4BP3O15049 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
N4BP3O15049 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
N4BP3O15049 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
N4BP3O15049 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
N4BP3O15049 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
N4BP3O15049 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
N4BP3O15049 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
N4BP3O15049 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms