Protein–RNA interactions for Protein: A6NLC8

Putative TAF11-like protein ENSP00000332601, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NLC8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NLC8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NLC8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NLC8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A6NLC8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NLC8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NLC8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NLC8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NLC8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NLC8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NLC8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NLC8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NLC8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NLC8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NLC8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NLC8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NLC8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NLC8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NLC8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NLC8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NLC8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A6NLC8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NLC8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NLC8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NLC8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NLC8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NLC8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NLC8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NLC8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NLC8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NLC8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NLC8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NLC8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NLC8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NLC8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NLC8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NLC8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NLC8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NLC8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NLC8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NLC8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NLC8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NLC8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NLC8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NLC8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NLC8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NLC8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NLC8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NLC8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NLC8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NLC8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NLC8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NLC8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NLC8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NLC8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NLC8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NLC8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NLC8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NLC8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NLC8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NLC8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NLC8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NLC8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NLC8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NLC8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NLC8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NLC8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NLC8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NLC8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NLC8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NLC8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NLC8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NLC8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NLC8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NLC8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NLC8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NLC8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NLC8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NLC8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NLC8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NLC8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NLC8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NLC8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NLC8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NLC8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NLC8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NLC8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NLC8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NLC8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NLC8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NLC8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NLC8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NLC8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NLC8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NLC8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NLC8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NLC8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NLC8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NLC8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NLC8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms