Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD8B2A6NJW9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD8B2A6NJW9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CD8B2A6NJW9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD8B2A6NJW9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CD8B2A6NJW9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD8B2A6NJW9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD8B2A6NJW9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD8B2A6NJW9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD8B2A6NJW9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CD8B2A6NJW9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD8B2A6NJW9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD8B2A6NJW9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD8B2A6NJW9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD8B2A6NJW9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD8B2A6NJW9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD8B2A6NJW9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD8B2A6NJW9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD8B2A6NJW9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD8B2A6NJW9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD8B2A6NJW9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD8B2A6NJW9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD8B2A6NJW9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD8B2A6NJW9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD8B2A6NJW9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD8B2A6NJW9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD8B2A6NJW9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD8B2A6NJW9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms