Protein–RNA interactions for Protein: A5X5Y0

HTR3E, 5-hydroxytryptamine receptor 3E, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3EA5X5Y0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTR3EA5X5Y0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR3EA5X5Y0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR3EA5X5Y0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR3EA5X5Y0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR3EA5X5Y0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTR3EA5X5Y0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR3EA5X5Y0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms