Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EME2A4GXA9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EME2A4GXA9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EME2A4GXA9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EME2A4GXA9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EME2A4GXA9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EME2A4GXA9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EME2A4GXA9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EME2A4GXA9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EME2A4GXA9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EME2A4GXA9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EME2A4GXA9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EME2A4GXA9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EME2A4GXA9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EME2A4GXA9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EME2A4GXA9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EME2A4GXA9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EME2A4GXA9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1106 ms