Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms