Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 FADS3-211ENST00000533676 5314 ntTSL 215.1■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 18
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AGGF1Q8N302 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.696e-9■■■□□ 17.8
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AGGF1Q8N302 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.566e-9■■■□□ 17.8
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AGGF1Q8N302 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.336e-9■■■□□ 17.8
AGGF1Q8N302 ARHGAP22-211ENST00000489984 467 ntTSL 515.04■□□□□ -06e-9■■■□□ 17.8
AGGF1Q8N302 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.126e-9■■■□□ 17.8
AGGF1Q8N302 RAB28-205ENST00000508274 1551 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.214e-13■■■□□ 17.8
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AGGF1Q8N302 ARHGAP22-215ENST00000515523 496 ntTSL 412.91□□□□□ -0.346e-9■■■□□ 17.8
AGGF1Q8N302 DCAF8-202ENST00000368073 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.576e-9■■■□□ 17.8
AGGF1Q8N302 DCAF8-209ENST00000466253 1078 ntTSL 510.04□□□□□ -0.86e-9■■■□□ 17.8
AGGF1Q8N302 DCAF8-203ENST00000368074 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.956e-9■■■□□ 17.8
AGGF1Q8N302 RAB28-207ENST00000511649 715 ntTSL 57.45□□□□□ -1.224e-13■■■□□ 17.8
AGGF1Q8N302 RAB28-204ENST00000504644 405 ntTSL 57.14□□□□□ -1.274e-13■■■□□ 17.8
AGGF1Q8N302 NAP1L1-209ENST00000547704 760 ntTSL 59.01□□□□□ -0.972e-7■■■□□ 17.8
AGGF1Q8N302 NAP1L1-221ENST00000551600 786 ntTSL 59.01□□□□□ -0.972e-7■■■□□ 17.8
AGGF1Q8N302 SLC5A9-202ENST00000425816 1950 ntTSL 1 (best)16.06■□□□□ 0.166e-7■■■□□ 17.7
AGGF1Q8N302 SLC5A9-204ENST00000441260 1046 ntTSL 215.44■□□□□ 0.066e-7■■■□□ 17.7
AGGF1Q8N302 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.116e-7■■■□□ 17.7
AGGF1Q8N302 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.36e-7■■■□□ 17.7
AGGF1Q8N302 SLC5A9-201ENST00000236495 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.676e-7■■■□□ 17.7
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