Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 BUB1B-209ENST00000559733 786 ntTSL 33.64□□□□□ -1.833e-7■■■■■ 38.2
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SF3B4Q15427 SPTBN2-211ENST00000617502 3498 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 38.1
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SF3B4Q15427 NECAP1-217ENST00000639276 2646 ntTSL 57.92□□□□□ -1.144e-7■■■■■ 38
SF3B4Q15427 NECAP1-218ENST00000639595 2587 ntTSL 57.79□□□□□ -1.164e-7■■■■■ 38
SF3B4Q15427 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.224e-7■■■■■ 38
SF3B4Q15427 NECAP1-204ENST00000540083 863 ntTSL 57.44□□□□□ -1.224e-7■■■■■ 38
SF3B4Q15427 NECAP1-213ENST00000638883 3940 ntTSL 57.4□□□□□ -1.234e-7■■■■■ 38
SF3B4Q15427 NECAP1-202ENST00000450991 2446 ntTSL 1 (best)7.14□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 38
SF3B4Q15427 NECAP1-224ENST00000640099 3313 ntTSL 57.14□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 38
SF3B4Q15427 NECAP1-205ENST00000541948 728 ntTSL 57.01□□□□□ -1.294e-7■■■■■ 38
SF3B4Q15427 NECAP1-208ENST00000545807 3113 ntTSL 56.97□□□□□ -1.294e-7■■■■■ 38
SF3B4Q15427 NECAP1-203ENST00000537796 3418 ntTSL 56.95□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 38
SF3B4Q15427 NECAP1-222ENST00000640072 3456 ntTSL 56.49□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 38
SF3B4Q15427 NECAP1-220ENST00000639841 1982 ntTSL 56.4□□□□□ -1.394e-7■■■■■ 38
SF3B4Q15427 NECAP1-226ENST00000640481 3216 ntTSL 55.97□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 38
SF3B4Q15427 ITPA-205ENST00000460676 488 ntTSL 38.55□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 37.9
SF3B4Q15427 PCYT2-215ENST00000573927 778 ntTSL 314.87□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 37.9
SF3B4Q15427 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 37.9
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