Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.967e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.17e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 ARL6IP1-205ENST00000563861 948 ntTSL 1 (best)6.89□□□□□ -1.317e-8■□□□□ 10.8
AATFQ9NY61 RPL3-215ENST00000481985 557 ntTSL 216.57■□□□□ 0.241e-323■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 RPL3-213ENST00000471290 481 ntTSL 213.38□□□□□ -0.271e-323■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 SNORD83A-201ENST00000386747 95 ntBASIC10.93□□□□□ -0.661e-323■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.144e-6■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.28□□□□□ -1.44e-6■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 AP1B1-209ENST00000472057 727 ntTSL 316.89■□□□□ 0.298e-15■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.158e-15■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.098e-15■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.058e-15■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.338e-15■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.398e-15■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 AP1B1-204ENST00000405198 3838 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.438e-15■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.49□□□□□ -1.378e-15■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.26□□□□□ -1.578e-15■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-323■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 ATP5B-202ENST00000547250 840 ntTSL 511.25□□□□□ -0.612e-9■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 RPL3-212ENST00000467105 1396 ntTSL 1 (best)17.4■□□□□ 0.381e-323■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61e-323■□□□□ 10.7
AATFQ9NY61 GABRE-202ENST00000417300 619 ntTSL 214.07□□□□□ -0.164e-8■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 210.89□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.914e-8■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 TMC6-220ENST00000591756 475 ntTSL 221.92■■□□□ 1.13e-7■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 TMC6-217ENST00000590934 386 ntTSL 513.69□□□□□ -0.223e-7■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 PTBP3-201ENST00000210227 734 ntTSL 223.94■■□□□ 1.423e-8■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 PTBP3-206ENST00000450374 368 ntTSL 513.18□□□□□ -0.33e-8■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 PTBP3-208ENST00000487997 389 ntTSL 311.54□□□□□ -0.563e-8■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.863e-8■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.913e-8■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.953e-8■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.253e-8■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.323e-8■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt23.21■■□□□ 1.312e-21■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 GLUL-210ENST00000484996 1369 ntTSL 325.31■■□□□ 1.641e-6■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.461e-6■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.321e-6■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-6■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 GLUL-211ENST00000489818 683 ntTSL 312.36□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 GLUL-207ENST00000463851 939 ntTSL 312.12□□□□□ -0.471e-6■□□□□ 10.6
AATFQ9NY61 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)25.5■■□□□ 1.673e-17■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 524.67■■□□□ 1.543e-17■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 224.07■■□□□ 1.443e-17■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.953e-17■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 419.83■□□□□ 0.773e-17■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 519.35■□□□□ 0.693e-17■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 419.12■□□□□ 0.653e-17■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 419.07■□□□□ 0.643e-17■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)17.94■□□□□ 0.463e-17■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 313.82□□□□□ -0.23e-17■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.011e-6■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-6■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 WDR74-208ENST00000538098 548 ntTSL 421.51■■□□□ 1.031e-47■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.891e-47■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.011e-47■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 TMC6-210ENST00000588792 843 ntTSL 222.14■■□□□ 1.131e-6■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 TMC6-211ENST00000589271 1099 ntTSL 520.59■□□□□ 0.891e-6■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 TMC6-205ENST00000586126 821 ntTSL 320.17■□□□□ 0.821e-6■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 TMC6-223ENST00000592594 551 ntTSL 419.85■□□□□ 0.771e-6■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 TMC6-207ENST00000586697 571 ntTSL 418.03■□□□□ 0.481e-6■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 TMC6-221ENST00000592063 743 ntTSL 517.06■□□□□ 0.321e-6■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 UBAP2L-206ENST00000428595 1419 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.132e-82■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 UBAP2L-212ENST00000465855 684 ntTSL 312.49□□□□□ -0.412e-82■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.442e-82■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.552e-82■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 UBAP2L-214ENST00000475373 838 ntTSL 211.46□□□□□ -0.572e-82■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 UBAP2L-208ENST00000433615 1789 ntTSL 1 (best)10.71□□□□□ -0.692e-82■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.82e-82■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.822e-82■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 UBAP2L-215ENST00000484696 611 ntTSL 29.79□□□□□ -0.842e-82■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.982e-82■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.51□□□□□ -1.372e-82■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 UBAP2L-219ENST00000495676 867 ntTSL 36.17□□□□□ -1.422e-82■□□□□ 10.5
AATFQ9NY61 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.052e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 DCUN1D2-203ENST00000438545 1025 ntTSL 526.6■■□□□ 1.852e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 DCUN1D2-211ENST00000496873 499 ntTSL 326.55■■□□□ 1.842e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 PTP4A2-215ENST00000533408 376 ntTSL 325.36■■□□□ 1.653e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)24.71■■□□□ 1.554e-8■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 PTP4A2-214ENST00000532289 610 ntTSL 323.89■■□□□ 1.413e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 TXNDC16-204ENST00000557374 542 ntTSL 423.83■■□□□ 1.412e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 PTP4A2-212ENST00000529477 568 ntTSL 323.19■■□□□ 1.33e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.232e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 TRMT2A-216ENST00000487668 1040 ntTSL 522.22■■□□□ 1.153e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.142e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.044e-8■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 PLCL1-202ENST00000435320 6665 ntTSL 220.11■□□□□ 0.812e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 TXNDC16-202ENST00000554399 504 ntTSL 420.04■□□□□ 0.82e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.712e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 XPO6-223ENST00000574435 765 ntTSL 519.33■□□□□ 0.682e-6■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 TRMT2A-205ENST00000444256 426 ntTSL 519.28■□□□□ 0.683e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 TRMT2A-215ENST00000487378 654 ntTSL 218.19■□□□□ 0.53e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 TRMT2A-206ENST00000444845 739 ntTSL 318.15■□□□□ 0.53e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 318.13■□□□□ 0.492e-14■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 HSPA9-204ENST00000504902 887 ntTSL 518.1■□□□□ 0.491e-15■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 HSPA9-205ENST00000505110 518 ntTSL 417.97■□□□□ 0.471e-15■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 PTP4A2-209ENST00000526960 793 ntTSL 517.68■□□□□ 0.423e-7■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 ALDOC-209ENST00000584086 686 ntTSL 317.49■□□□□ 0.394e-8■□□□□ 10.4
AATFQ9NY61 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-6■□□□□ 10.4
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