Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPHQ15003 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAPHQ15003 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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