Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ACSL3-204ENST00000413316 650 ntTSL 411.03□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-218ENST00000510778 716 ntTSL 57.28□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-225ENST00000514380 1519 ntTSL 27.03□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-231ENST00000515573 698 ntTSL 56.73□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-215ENST00000507574 607 ntTSL 54.96□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.029e-7■■■■■ 32.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 518.04■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 32.3
UTP3Q9NQZ2 XPO1-207ENST00000436018 318 ntTSL 45.63□□□□□ -1.512e-8■■■■■ 32.3
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.015e-7■■■■■ 32.2
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-208ENST00000475514 1192 ntTSL 521.27■■□□□ 15e-7■■■■■ 32.2
UTP3Q9NQZ2 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 32.2
UTP3Q9NQZ2 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 32.2
UTP3Q9NQZ2 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 32.2
UTP3Q9NQZ2 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.993e-7■■■■■ 32.2
UTP3Q9NQZ2 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.293e-7■■■■■ 32.2
UTP3Q9NQZ2 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 32.2
UTP3Q9NQZ2 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 32.2
UTP3Q9NQZ2 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 32.2
UTP3Q9NQZ2 FASTK-216ENST00000496663 818 ntTSL 223.63■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 32.1
UTP3Q9NQZ2 FASTK-205ENST00000461979 720 ntTSL 522.66■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 32.1
UTP3Q9NQZ2 RBM26-206ENST00000472143 2192 ntTSL 227.66■■■□□ 2.022e-6■■■■■ 32.1
UTP3Q9NQZ2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.37e-7■■■■■ 32.1
UTP3Q9NQZ2 FAM193B-211ENST00000508298 479 ntTSL 520■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 32.1
UTP3Q9NQZ2 FAM193B-208ENST00000506955 4604 ntTSL 1 (best)18.5■□□□□ 0.557e-7■■■■■ 32.1
UTP3Q9NQZ2 DAPK3-204ENST00000594894 617 ntTSL 321.43■■□□□ 1.022e-14■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 MAN2A2-229ENST00000561240 460 ntTSL 418.5■□□□□ 0.554e-8■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.422e-14■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 TRIP6-203ENST00000429658 646 ntTSL 316.62■□□□□ 0.252e-14■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 MAN2A2-205ENST00000558171 790 ntTSL 516.5■□□□□ 0.234e-8■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 TRIP6-207ENST00000488670 615 ntTSL 315.44■□□□□ 0.062e-14■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 ORC4-209ENST00000483608 691 ntTSL 212.11□□□□□ -0.479e-7■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 FAM83A-204ENST00000521468 614 ntTSL 311.81□□□□□ -0.525e-10■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 ORC4-207ENST00000478904 573 ntTSL 211.08□□□□□ -0.649e-7■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 TNIP1-215ENST00000522574 1394 ntTSL 210.13□□□□□ -0.795e-8■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 EFTUD2-204ENST00000585794 578 ntTSL 29.57□□□□□ -0.885e-10■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 DDX42-209ENST00000579511 594 ntTSL 58.38□□□□□ -1.075e-10■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 TNIP1-204ENST00000517504 562 ntTSL 57.76□□□□□ -1.175e-8■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 RUNX1-215ENST00000479325 537 ntTSL 1 (best)7.04□□□□□ -1.289e-7■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 DDX42-205ENST00000577978 581 ntTSL 56.63□□□□□ -1.355e-10■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-209ENST00000589318 1903 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-202ENST00000324340 1355 ntTSL 1 (best)13.64□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 LUC7L2-207ENST00000498518 2837 ntTSL 24.95□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 EIF3D-208ENST00000458572 883 ntTSL 39.24□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 ALDOA-224ENST00000568435 935 ntTSL 1 (best)18.15■□□□□ 0.51e-15■■■■■ 32
UTP3Q9NQZ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.185e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.935e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CLASRP-205ENST00000585432 290 ntTSL 218.57■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 SNX17-209ENST00000494893 966 ntTSL 218.33■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-216ENST00000449311 681 ntTSL 518.13■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-211ENST00000421589 824 ntTSL 217.22■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 SENP2-202ENST00000413407 2383 ntTSL 216.88■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 PIGT-219ENST00000638489 957 ntTSL 1 (best)16.73■□□□□ 0.275e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5F1-206ENST00000493119 716 ntTSL 316.1■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-210ENST00000420216 668 ntTSL 515.55■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 TMEM94-228ENST00000583296 569 ntTSL 215.42■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 MRPL18-203ENST00000479638 600 ntTSL 515.38■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 PIGT-245ENST00000639417 880 ntTSL 315.27■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 05e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 MRPL18-204ENST00000480842 1075 ntTSL 315.01□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 PIGT-242ENST00000639286 861 ntTSL 514.54□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-208ENST00000414893 528 ntTSL 314.46□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 PIGT-239ENST00000639235 961 ntTSL 1 (best)14.2□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 PIGT-213ENST00000638353 970 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 PIGT-244ENST00000639382 1193 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-214ENST00000435719 817 ntTSL 313.96□□□□□ -0.175e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-209ENST00000417287 610 ntTSL 513.91□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 MRPL18-202ENST00000476826 758 ntTSL 313.59□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 AGPAT4-203ENST00000366911 7705 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 TMEM94-227ENST00000583071 581 ntTSL 313.39□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 PIGT-233ENST00000638953 952 ntTSL 512.87□□□□□ -0.355e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-207ENST00000414281 772 ntTSL 411.95□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 AGPAT4-201ENST00000320285 7865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-204ENST00000372798 1563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.535e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 BAZ2A-216ENST00000551996 849 ntTSL 511.67□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-215ENST00000446031 273 ntTSL 311.4□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-202ENST00000372792 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 TMEM94-226ENST00000582843 570 ntTSL 411.06□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 AGPAT4-204ENST00000436279 875 ntTSL 1 (best)10.87□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-213ENST00000427843 739 ntTSL 510.79□□□□□ -0.685e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 PIGT-218ENST00000638478 1076 ntTSL 310.5□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 ZEB2-219ENST00000475115 536 ntTSL 510.44□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 TPTEP1-203ENST00000415121 1067 ntTSL 1 (best)10.32□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 TPTEP1-201ENST00000383140 971 ntTSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 SENP2-210ENST00000473760 738 ntTSL 29.72□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 SENP2-212ENST00000478001 541 ntTSL 49.22□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 BAZ2A-205ENST00000547650 614 ntTSL 39.15□□□□□ -0.945e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-201ENST00000340450 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.065e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 LRCH3-205ENST00000433298 977 ntTSL 57.77□□□□□ -1.175e-7■■■■■ 31.9
UTP3Q9NQZ2 CAP1-212ENST00000424977 702 ntTSL 57.3□□□□□ -1.245e-7■■■■■ 31.9
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