RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639286.1

PIGT-242, Transcript of phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class T, humanhuman

TSL 5

Gene PIGT, Length 861 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGT-242ENST00000639286 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.86■■■□□ 2.85
PIGT-242ENST00000639286 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.14■■■□□ 2.26
PIGT-242ENST00000639286 ABCC9O60706 1549 aa28.84■■■□□ 2.21
PIGT-242ENST00000639286 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.46■■□□□ 1.99
PIGT-242ENST00000639286 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.4■■□□□ 1.98
PIGT-242ENST00000639286 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
PIGT-242ENST00000639286 NACADO15069 1562 aa27.37■■□□□ 1.97
PIGT-242ENST00000639286 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.2■■□□□ 1.94
PIGT-242ENST00000639286 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.13■■□□□ 1.93
PIGT-242ENST00000639286 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.03■■□□□ 1.92
PIGT-242ENST00000639286 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.91■■□□□ 1.9
PIGT-242ENST00000639286 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
PIGT-242ENST00000639286 SCRIBQ14160 1630 aa26.68■■□□□ 1.86
PIGT-242ENST00000639286 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.66■■□□□ 1.86
PIGT-242ENST00000639286 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.23■■□□□ 1.79
PIGT-242ENST00000639286 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.04■■□□□ 1.76
PIGT-242ENST00000639286 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PIGT-242ENST00000639286 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.93■■□□□ 1.74
PIGT-242ENST00000639286 SMARCA4P51532 1647 aa25.49■■□□□ 1.67
PIGT-242ENST00000639286 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PIGT-242ENST00000639286 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.37■■□□□ 1.65
PIGT-242ENST00000639286 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.33■■□□□ 1.65
PIGT-242ENST00000639286 NCAPD3P42695 1498 aa25.28■■□□□ 1.64
PIGT-242ENST00000639286 SMARCA2P51531 1590 aa25.26■■□□□ 1.63
PIGT-242ENST00000639286 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.21■■□□□ 1.63
PIGT-242ENST00000639286 HMGXB3Q12766 1538 aa25.16■■□□□ 1.62
PIGT-242ENST00000639286 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PIGT-242ENST00000639286 WIZO95785 1651 aa25.1■■□□□ 1.61
PIGT-242ENST00000639286 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PIGT-242ENST00000639286 ERCC6Q03468 1493 aa24.89■■□□□ 1.57
PIGT-242ENST00000639286 NESP48681 1621 aa24.79■■□□□ 1.56
PIGT-242ENST00000639286 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PIGT-242ENST00000639286 CUX2O14529 1486 aa24.76■■□□□ 1.55
PIGT-242ENST00000639286 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.74■■□□□ 1.55
PIGT-242ENST00000639286 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.59■■□□□ 1.53
PIGT-242ENST00000639286 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.55■■□□□ 1.52
PIGT-242ENST00000639286 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.53■■□□□ 1.52
PIGT-242ENST00000639286 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.52■■□□□ 1.52
PIGT-242ENST00000639286 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PIGT-242ENST00000639286 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PIGT-242ENST00000639286 CFTRP13569 1480 aa24.43■■□□□ 1.5
PIGT-242ENST00000639286 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.41■■□□□ 1.5
PIGT-242ENST00000639286 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.29■■□□□ 1.48
PIGT-242ENST00000639286 PRDM2Q13029 1718 aa24.24■■□□□ 1.47
PIGT-242ENST00000639286 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.23■■□□□ 1.47
PIGT-242ENST00000639286 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.19■■□□□ 1.46
PIGT-242ENST00000639286 WDR62O43379 1518 aa24.13■■□□□ 1.45
PIGT-242ENST00000639286 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PIGT-242ENST00000639286 TOPBP1Q92547 1522 aa23.92■■□□□ 1.42
PIGT-242ENST00000639286 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.87■■□□□ 1.41
PIGT-242ENST00000639286 ABCC8Q09428 1581 aa23.82■■□□□ 1.4
PIGT-242ENST00000639286 TRIM41Q8WV44 630 aa23.79■■□□□ 1.4
PIGT-242ENST00000639286 CUX1P39880 1505 aa23.79■■□□□ 1.4
PIGT-242ENST00000639286 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PIGT-242ENST00000639286 IFT140Q96RY7 1462 aa23.7■■□□□ 1.38
PIGT-242ENST00000639286 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PIGT-242ENST00000639286 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.68■■□□□ 1.38
PIGT-242ENST00000639286 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PIGT-242ENST00000639286 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.66■■□□□ 1.38
PIGT-242ENST00000639286 OSCARQ8IYS5 282 aa23.63■■□□□ 1.37
PIGT-242ENST00000639286 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
PIGT-242ENST00000639286 SYNJ1O43426 1573 aa23.61■■□□□ 1.37
PIGT-242ENST00000639286 SOGA1O94964 1423 aa23.6■■□□□ 1.37
PIGT-242ENST00000639286 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PIGT-242ENST00000639286 TOP2BQ02880 1626 aa23.56■■□□□ 1.36
PIGT-242ENST00000639286 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.56■■□□□ 1.36
PIGT-242ENST00000639286 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.362e-6■□□□□ 8.9
PIGT-242ENST00000639286 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PIGT-242ENST00000639286 WDR97A6NE52 1622 aa23.48■■□□□ 1.35
PIGT-242ENST00000639286 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.44■■□□□ 1.34
PIGT-242ENST00000639286 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.44■■□□□ 1.34
PIGT-242ENST00000639286 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.44■■□□□ 1.34
PIGT-242ENST00000639286 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.42■■□□□ 1.34
PIGT-242ENST00000639286 CHD1O14646 1710 aa23.4■■□□□ 1.34
PIGT-242ENST00000639286 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.34■■□□□ 1.33
PIGT-242ENST00000639286 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.33■■□□□ 1.33
PIGT-242ENST00000639286 ARHGEF11O15085 1522 aa23.32■■□□□ 1.32
PIGT-242ENST00000639286 GRIN2BQ13224 1484 aa23.3■■□□□ 1.32
PIGT-242ENST00000639286 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.3■■□□□ 1.32
PIGT-242ENST00000639286 PBRM1Q86U86 1689 aa23.3■■□□□ 1.32
PIGT-242ENST00000639286 FBLN2P98095 1184 aa23.28■■□□□ 1.32
PIGT-242ENST00000639286 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PIGT-242ENST00000639286 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.15■■□□□ 1.3
PIGT-242ENST00000639286 SYNJ2O15056 1496 aa23.15■■□□□ 1.3
PIGT-242ENST00000639286 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PIGT-242ENST00000639286 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.13■■□□□ 1.29
PIGT-242ENST00000639286 ADAMTS12P58397 1594 aa23.12■■□□□ 1.29
PIGT-242ENST00000639286 ARAP1Q96P48 1450 aa23.1■■□□□ 1.29
PIGT-242ENST00000639286 KIF27Q86VH2 1401 aa23.08■■□□□ 1.29
PIGT-242ENST00000639286 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.05■■□□□ 1.28
PIGT-242ENST00000639286 IGF1RP08069 1367 aa23.03■■□□□ 1.28
PIGT-242ENST00000639286 GRIN2AQ12879 1464 aa23.03■■□□□ 1.28
PIGT-242ENST00000639286 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.02■■□□□ 1.28
PIGT-242ENST00000639286 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.02■■□□□ 1.28
PIGT-242ENST00000639286 CEP170Q5SW79 1584 aa22.95■■□□□ 1.26
PIGT-242ENST00000639286 CUL7Q14999 1698 aa22.93■■□□□ 1.26
PIGT-242ENST00000639286 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PIGT-242ENST00000639286 NUP160Q12769 1436 aa22.91■■□□□ 1.26
PIGT-242ENST00000639286 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.91■■□□□ 1.26
PIGT-242ENST00000639286 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms