Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 GANAB-212ENST00000534419 640 ntTSL 410.15□□□□□ -0.781e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CFLAR-222ENST00000474842 1091 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.841e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CDK5RAP2-219ENST00000495406 635 ntTSL 29.76□□□□□ -0.851e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 PSMD11-210ENST00000584340 559 ntTSL 49.57□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ERMP1-201ENST00000214893 4974 ntTSL 1 (best)9.02□□□□□ -0.971e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-226ENST00000638443 2146 ntTSL 58.41□□□□□ -1.065e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SEPT8-202ENST00000371478 737 ntTSL 38.36□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CACUL1-205ENST00000490610 394 ntTSL 28.08□□□□□ -1.127e-9■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RNF4-203ENST00000503123 298 ntTSL 58.01□□□□□ -1.131e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CDK5RAP2-210ENST00000474262 549 ntTSL 27.89□□□□□ -1.151e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-209ENST00000526567 560 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.155e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-216ENST00000533972 452 ntTSL 37.59□□□□□ -1.191e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.235e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 KPNB1-213ENST00000583013 742 ntTSL 37.34□□□□□ -1.231e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RNF4-220ENST00000513578 545 ntTSL 47.31□□□□□ -1.241e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 KDM5C-210ENST00000467093 446 ntTSL 37.08□□□□□ -1.281e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 TIMM17A-203ENST00000482943 2523 ntTSL 27.04□□□□□ -1.281e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.295e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 PSMB4-203ENST00000474100 755 ntTSL 56.58□□□□□ -1.361e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RAB10-203ENST00000473035 571 ntTSL 46.42□□□□□ -1.381e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 TPT1-209ENST00000528619 731 ntTSL 26.29□□□□□ -1.44e-11■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.441e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CAPRIN1-208ENST00000530008 580 ntTSL 45.9□□□□□ -1.465e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RAB10-202ENST00000462003 584 ntTSL 45.78□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-213ENST00000531998 840 ntTSL 35.78□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.551e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RNF4-217ENST00000511892 547 ntTSL 45.26□□□□□ -1.571e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.585e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 TRIT1-207ENST00000467774 464 ntTSL 25□□□□□ -1.611e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.621e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 PRPF40A-208ENST00000472760 243 ntTSL 24.76□□□□□ -1.651e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CAPRIN1-211ENST00000532755 565 ntTSL 44.76□□□□□ -1.655e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.661e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SEC61A1-204ENST00000481210 521 ntTSL 54.65□□□□□ -1.671e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 TPT1-211ENST00000530245 530 ntTSL 34.64□□□□□ -1.674e-11■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SUCO-208ENST00000609685 761 ntTSL 24.51□□□□□ -1.691e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.691e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 FAM76B-203ENST00000535919 451 ntTSL 34.45□□□□□ -1.71e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SQLE-202ENST00000518604 743 ntTSL 24.41□□□□□ -1.71e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EDEM3-205ENST00000466606 487 ntTSL 34.19□□□□□ -1.741e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.741e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ECT2-215ENST00000487073 628 ntTSL 33.95□□□□□ -1.785e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-225ENST00000601453 582 ntTSL 33.94□□□□□ -1.785e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.825e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RNF4-211ENST00000509206 490 ntTSL 33.6□□□□□ -1.831e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.841e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.895e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.895e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 TARDBP-220ENST00000618606 584 ntTSL 23.22□□□□□ -1.895e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CAPRIN1-214ENST00000533641 429 ntTSL 42.94□□□□□ -1.945e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 LMAN1-204ENST00000587940 442 ntTSL 22.93□□□□□ -1.941e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CNOT2-235ENST00000552151 1682 ntTSL 22.85□□□□□ -1.951e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RNF4-219ENST00000513450 416 ntTSL 52.28□□□□□ -2.041e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 DMTF1-236ENST00000583833 171 ntTSL 32.07□□□□□ -2.081e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-221ENST00000459656 1901 ntTSL 1 (best)17.9■□□□□ 0.464e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-225ENST00000471533 329 ntTSL 317.8■□□□□ 0.444e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-216ENST00000444012 605 ntTSL 416.86■□□□□ 0.294e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-212ENST00000428692 541 ntTSL 416.49■□□□□ 0.234e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-220ENST00000457757 835 ntTSL 516.49■□□□□ 0.234e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-211ENST00000423749 771 ntTSL 516.42■□□□□ 0.224e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-214ENST00000439084 584 ntTSL 312.79□□□□□ -0.364e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-226ENST00000471601 1730 ntTSL 212.66□□□□□ -0.384e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 DCAF11-218ENST00000559144 1011 ntTSL 212.2□□□□□ -0.464e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.514e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-219ENST00000453663 637 ntTSL 49.03□□□□□ -0.964e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-207ENST00000409397 920 ntTSL 38.1□□□□□ -1.114e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-215ENST00000439395 561 ntTSL 44.94□□□□□ -1.624e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 VASP-204ENST00000587444 240 ntTSL 25.61□□□□□ -1.512e-9■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 PPIL2-209ENST00000485930 149 ntTSL 35.32□□□□□ -1.561e-28■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CLSTN3-208ENST00000538933 583 ntTSL 311.2□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SMG5-203ENST00000473643 541 ntTSL 28.12□□□□□ -1.111e-8■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 EPB41-209ENST00000462032 752 ntTSL 25.21□□□□□ -1.589e-21■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.362e-18■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC11.45□□□□□ -0.584e-11■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 DXO-211ENST00000487914 1016 ntTSL 516.33■□□□□ 0.26e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.096e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.36e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 BMP4-208ENST00000559642 505 ntTSL 311.65□□□□□ -0.546e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 BMP4-205ENST00000558984 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.66e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 BMP4-202ENST00000417573 1784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.76e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 FREM1-206ENST00000466679 741 ntTSL 310.2□□□□□ -0.786e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.946e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 FREM1-201ENST00000380875 6126 ntTSL 1 (best)8.98□□□□□ -0.976e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.046e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 FREM1-209ENST00000497634 701 ntTSL 32.61□□□□□ -1.996e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.784e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 USP19-214ENST00000488993 1116 ntTSL 519.57■□□□□ 0.724e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 ACSS2-205ENST00000467019 504 ntTSL 419.55■□□□□ 0.724e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.674e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.384e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 RFWD3-203ENST00000571776 936 ntTSL 216.92■□□□□ 0.34e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.34e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 MLF2-208ENST00000541305 564 ntTSL 216.9■□□□□ 0.34e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 USP19-215ENST00000491859 919 ntTSL 316.8■□□□□ 0.284e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.264e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 MLF2-209ENST00000541346 1234 ntTSL 515.46■□□□□ 0.074e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 MLF2-205ENST00000537126 851 ntTSL 515.26■□□□□ 0.034e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 USP19-212ENST00000480163 397 ntTSL 313.93□□□□□ -0.184e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-205ENST00000560411 1088 ntTSL 1 (best)13.2□□□□□ -0.34e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 KLF3-202ENST00000482150 517 ntTSL 212.92□□□□□ -0.344e-6■□□□□ 8.1
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