RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488993.5

USP19-214, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, humanhuman

TSL 5

Gene USP19, Length 1,116 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19-214ENST00000488993 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.2■■■■■ 5.95
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USP19-214ENST00000488993 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.35■■■■■ 4.53
USP19-214ENST00000488993 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.3■■■■■ 4.52
USP19-214ENST00000488993 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.28■■■■■ 4.52
USP19-214ENST00000488993 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.24■■■■■ 4.51
USP19-214ENST00000488993 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.39■■■■■ 4.38
USP19-214ENST00000488993 SCRIBQ14160 1630 aa42.17■■■■■ 4.34
USP19-214ENST00000488993 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.02■■■■■ 4.32
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USP19-214ENST00000488993 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.57■■■■■ 4.09
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USP19-214ENST00000488993 SMARCA2P51531 1590 aa40.06■■■■■ 4
USP19-214ENST00000488993 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.05■■■■■ 4
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USP19-214ENST00000488993 NESP48681 1621 aa38.9■■■■□ 3.82
USP19-214ENST00000488993 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.89■■■■□ 3.82
USP19-214ENST00000488993 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.85■■■■□ 3.81
USP19-214ENST00000488993 CFTRP13569 1480 aa38.73■■■■□ 3.79
USP19-214ENST00000488993 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.59■■■■□ 3.77
USP19-214ENST00000488993 ERCC6Q03468 1493 aa38.55■■■■□ 3.76
USP19-214ENST00000488993 PRDM2Q13029 1718 aa38.5■■■■□ 3.75
USP19-214ENST00000488993 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.48■■■■□ 3.75
USP19-214ENST00000488993 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.4■■■■□ 3.74
USP19-214ENST00000488993 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.3■■■■□ 3.72
USP19-214ENST00000488993 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.25■■■■□ 3.71
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USP19-214ENST00000488993 WDR62O43379 1518 aa38.05■■■■□ 3.68
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USP19-214ENST00000488993 ABCC8Q09428 1581 aa37.88■■■■□ 3.65
USP19-214ENST00000488993 TOPBP1Q92547 1522 aa37.84■■■■□ 3.65
USP19-214ENST00000488993 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.84■■■■□ 3.65
USP19-214ENST00000488993 CUX1P39880 1505 aa37.71■■■■□ 3.63
USP19-214ENST00000488993 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.6■■■■□ 3.61
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USP19-214ENST00000488993 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.5■■■■□ 3.59
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USP19-214ENST00000488993 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.01■■■■□ 3.52
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USP19-214ENST00000488993 TRIM41Q8WV44 630 aa36.97■■■■□ 3.51
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USP19-214ENST00000488993 KIF27Q86VH2 1401 aa36.78■■■■□ 3.48
USP19-214ENST00000488993 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.78■■■■□ 3.48
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USP19-214ENST00000488993 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.75■■■■□ 3.47
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USP19-214ENST00000488993 IGF1RP08069 1367 aa36.62■■■■□ 3.45
USP19-214ENST00000488993 ADAMTS12P58397 1594 aa36.6■■■■□ 3.45
USP19-214ENST00000488993 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.59■■■■□ 3.45
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USP19-214ENST00000488993 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.25■■■■□ 3.39
USP19-214ENST00000488993 CEP170Q5SW79 1584 aa36.24■■■■□ 3.39
USP19-214ENST00000488993 PRXQ9BXM0 1461 aa36.21■■■■□ 3.39
USP19-214ENST00000488993 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.21■■■■□ 3.39
USP19-214ENST00000488993 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
USP19-214ENST00000488993 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.03■■■■□ 3.36
USP19-214ENST00000488993 SHROOM2Q13796 1616 aa35.98■■■■□ 3.35
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