RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581525.1

SNORD55-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 55, humanhuman

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Gene SNORD55, Length 80 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD55-201ENST00000581525 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.86■■■□□ 2.53
SNORD55-201ENST00000581525 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.38■■□□□ 1.97
SNORD55-201ENST00000581525 ABCC9O60706 1549 aa26.75■■□□□ 1.87
SNORD55-201ENST00000581525 NACADO15069 1562 aa25.8■■□□□ 1.72
SNORD55-201ENST00000581525 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.78■■□□□ 1.72
SNORD55-201ENST00000581525 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.76■■□□□ 1.71
SNORD55-201ENST00000581525 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SNORD55-201ENST00000581525 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.64■■□□□ 1.7
SNORD55-201ENST00000581525 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.61■■□□□ 1.69
SNORD55-201ENST00000581525 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.12■■□□□ 1.61
SNORD55-201ENST00000581525 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.05■■□□□ 1.6
SNORD55-201ENST00000581525 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
SNORD55-201ENST00000581525 SCRIBQ14160 1630 aa24.87■■□□□ 1.57
SNORD55-201ENST00000581525 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.85■■□□□ 1.57
SNORD55-201ENST00000581525 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.71■■□□□ 1.55
SNORD55-201ENST00000581525 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SNORD55-201ENST00000581525 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.22■■□□□ 1.47
SNORD55-201ENST00000581525 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.08■■□□□ 1.45
SNORD55-201ENST00000581525 SMARCA4P51532 1647 aa23.88■■□□□ 1.41
SNORD55-201ENST00000581525 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SNORD55-201ENST00000581525 NCAPD3P42695 1498 aa23.87■■□□□ 1.41
SNORD55-201ENST00000581525 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.83■■□□□ 1.41
SNORD55-201ENST00000581525 SMARCA2P51531 1590 aa23.76■■□□□ 1.39
SNORD55-201ENST00000581525 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.75■■□□□ 1.39
SNORD55-201ENST00000581525 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.74■■□□□ 1.39
SNORD55-201ENST00000581525 HMGXB3Q12766 1538 aa23.69■■□□□ 1.38
SNORD55-201ENST00000581525 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SNORD55-201ENST00000581525 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SNORD55-201ENST00000581525 WIZO95785 1651 aa23.41■■□□□ 1.34
SNORD55-201ENST00000581525 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SNORD55-201ENST00000581525 NESP48681 1621 aa23.17■■□□□ 1.3
SNORD55-201ENST00000581525 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.16■■□□□ 1.3
SNORD55-201ENST00000581525 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.14■■□□□ 1.3
SNORD55-201ENST00000581525 ERCC6Q03468 1493 aa23.03■■□□□ 1.28
SNORD55-201ENST00000581525 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.02■■□□□ 1.28
SNORD55-201ENST00000581525 CFTRP13569 1480 aa23.01■■□□□ 1.27
SNORD55-201ENST00000581525 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.98■■□□□ 1.27
SNORD55-201ENST00000581525 CUX2O14529 1486 aa22.92■■□□□ 1.26
SNORD55-201ENST00000581525 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SNORD55-201ENST00000581525 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.83■■□□□ 1.24
SNORD55-201ENST00000581525 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.8■■□□□ 1.24
SNORD55-201ENST00000581525 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SNORD55-201ENST00000581525 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.75■■□□□ 1.23
SNORD55-201ENST00000581525 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.74■■□□□ 1.23
SNORD55-201ENST00000581525 WDR62O43379 1518 aa22.69■■□□□ 1.22
SNORD55-201ENST00000581525 PRDM2Q13029 1718 aa22.66■■□□□ 1.22
SNORD55-201ENST00000581525 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SNORD55-201ENST00000581525 ABCC8Q09428 1581 aa22.5■■□□□ 1.19
SNORD55-201ENST00000581525 TOPBP1Q92547 1522 aa22.45■■□□□ 1.18
SNORD55-201ENST00000581525 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.4■■□□□ 1.18
SNORD55-201ENST00000581525 IFT140Q96RY7 1462 aa22.33■■□□□ 1.16
SNORD55-201ENST00000581525 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.29■■□□□ 1.16
SNORD55-201ENST00000581525 CUX1P39880 1505 aa22.26■■□□□ 1.15
SNORD55-201ENST00000581525 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SNORD55-201ENST00000581525 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SNORD55-201ENST00000581525 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SNORD55-201ENST00000581525 SOGA1O94964 1423 aa22.18■■□□□ 1.14
SNORD55-201ENST00000581525 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.17■■□□□ 1.14
SNORD55-201ENST00000581525 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.14■■□□□ 1.13
SNORD55-201ENST00000581525 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SNORD55-201ENST00000581525 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SNORD55-201ENST00000581525 WDR97A6NE52 1622 aa22.07■■□□□ 1.12
SNORD55-201ENST00000581525 TOP2BQ02880 1626 aa22.07■■□□□ 1.12
SNORD55-201ENST00000581525 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.06■■□□□ 1.12
SNORD55-201ENST00000581525 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SNORD55-201ENST00000581525 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNORD55-201ENST00000581525 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.02■■□□□ 1.12
SNORD55-201ENST00000581525 SYNJ1O43426 1573 aa22.02■■□□□ 1.12
SNORD55-201ENST00000581525 OSCARQ8IYS5 282 aa21.98■■□□□ 1.11
SNORD55-201ENST00000581525 GRIN2BQ13224 1484 aa21.92■■□□□ 1.1
SNORD55-201ENST00000581525 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.91■■□□□ 1.1
SNORD55-201ENST00000581525 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.88■■□□□ 1.09
SNORD55-201ENST00000581525 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SNORD55-201ENST00000581525 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.83■■□□□ 1.09
SNORD55-201ENST00000581525 SYNJ2O15056 1496 aa21.77■■□□□ 1.08
SNORD55-201ENST00000581525 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SNORD55-201ENST00000581525 PBRM1Q86U86 1689 aa21.75■■□□□ 1.07
SNORD55-201ENST00000581525 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.75■■□□□ 1.07
SNORD55-201ENST00000581525 FBLN2P98095 1184 aa21.73■■□□□ 1.07
SNORD55-201ENST00000581525 CHD1O14646 1710 aa21.72■■□□□ 1.07
SNORD55-201ENST00000581525 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.68■■□□□ 1.06
SNORD55-201ENST00000581525 IGF1RP08069 1367 aa21.67■■□□□ 1.06
SNORD55-201ENST00000581525 KIF27Q86VH2 1401 aa21.66■■□□□ 1.06
SNORD55-201ENST00000581525 ADAMTS12P58397 1594 aa21.64■■□□□ 1.05
SNORD55-201ENST00000581525 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.62■■□□□ 1.05
SNORD55-201ENST00000581525 GRIN2AQ12879 1464 aa21.62■■□□□ 1.05
SNORD55-201ENST00000581525 NUP160Q12769 1436 aa21.59■■□□□ 1.05
SNORD55-201ENST00000581525 TRIM41Q8WV44 630 aa21.56■■□□□ 1.04
SNORD55-201ENST00000581525 ARHGEF11O15085 1522 aa21.55■■□□□ 1.04
SNORD55-201ENST00000581525 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.52■■□□□ 1.04
SNORD55-201ENST00000581525 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.52■■□□□ 1.04
SNORD55-201ENST00000581525 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.52■■□□□ 1.04
SNORD55-201ENST00000581525 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.48■■□□□ 1.03
SNORD55-201ENST00000581525 CEP170Q5SW79 1584 aa21.48■■□□□ 1.03
SNORD55-201ENST00000581525 CUL7Q14999 1698 aa21.47■■□□□ 1.03
SNORD55-201ENST00000581525 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.45■■□□□ 1.02
SNORD55-201ENST00000581525 ARAP1Q96P48 1450 aa21.39■■□□□ 1.02
SNORD55-201ENST00000581525 SHROOM2Q13796 1616 aa21.38■■□□□ 1.01
SNORD55-201ENST00000581525 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.37■■□□□ 1.01
SNORD55-201ENST00000581525 JPH4Q96JJ6 628 aa21.37■■□□□ 1.01
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