Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms