Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms