Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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