RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341735.3

MESP2-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP2, Length 1,552 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP2-201ENST00000341735 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.58■■■■■ 6.01
MESP2-201ENST00000341735 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.47■■■■■ 5.03
MESP2-201ENST00000341735 ABCC9O60706 1549 aa44.91■■■■■ 4.78
MESP2-201ENST00000341735 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
MESP2-201ENST00000341735 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.75■■■■■ 4.59
MESP2-201ENST00000341735 NACADO15069 1562 aa43.55■■■■■ 4.56
MESP2-201ENST00000341735 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.51■■■■■ 4.56
MESP2-201ENST00000341735 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.47■■■■■ 4.55
MESP2-201ENST00000341735 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.45■■■■■ 4.55
MESP2-201ENST00000341735 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.52■■■■■ 4.4
MESP2-201ENST00000341735 SCRIBQ14160 1630 aa42.47■■■■■ 4.39
MESP2-201ENST00000341735 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.12■■■■■ 4.33
MESP2-201ENST00000341735 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.1■■■■■ 4.33
MESP2-201ENST00000341735 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.93■■■■■ 4.3
MESP2-201ENST00000341735 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
MESP2-201ENST00000341735 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.9■■■■■ 4.14
MESP2-201ENST00000341735 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
MESP2-201ENST00000341735 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.69■■■■■ 4.1
MESP2-201ENST00000341735 SMARCA4P51532 1647 aa40.67■■■■■ 4.1
MESP2-201ENST00000341735 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.66■■■■■ 4.1
MESP2-201ENST00000341735 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.54■■■■■ 4.08
MESP2-201ENST00000341735 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.3■■■■■ 4.04
MESP2-201ENST00000341735 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
MESP2-201ENST00000341735 SMARCA2P51531 1590 aa40.27■■■■■ 4.04
MESP2-201ENST00000341735 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.24■■■■■ 4.03
MESP2-201ENST00000341735 NCAPD3P42695 1498 aa40.17■■■■■ 4.02
MESP2-201ENST00000341735 WIZO95785 1651 aa40.15■■■■■ 4.02
MESP2-201ENST00000341735 HMGXB3Q12766 1538 aa40.02■■■■■ 4
MESP2-201ENST00000341735 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
MESP2-201ENST00000341735 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
MESP2-201ENST00000341735 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
MESP2-201ENST00000341735 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.28■■■■□ 3.88
MESP2-201ENST00000341735 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.05■■■■□ 3.84
MESP2-201ENST00000341735 NESP48681 1621 aa39.04■■■■□ 3.84
MESP2-201ENST00000341735 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.02■■■■□ 3.84
MESP2-201ENST00000341735 CFTRP13569 1480 aa38.93■■■■□ 3.82
MESP2-201ENST00000341735 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.75■■■■□ 3.79
MESP2-201ENST00000341735 PRDM2Q13029 1718 aa38.72■■■■□ 3.79
MESP2-201ENST00000341735 ERCC6Q03468 1493 aa38.66■■■■□ 3.78
MESP2-201ENST00000341735 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.61■■■■□ 3.77
MESP2-201ENST00000341735 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.6■■■■□ 3.77
MESP2-201ENST00000341735 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.49■■■■□ 3.75
MESP2-201ENST00000341735 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.3■■■■□ 3.72
MESP2-201ENST00000341735 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
MESP2-201ENST00000341735 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
MESP2-201ENST00000341735 WDR62O43379 1518 aa38.16■■■■□ 3.7
MESP2-201ENST00000341735 ABCC8Q09428 1581 aa38.08■■■■□ 3.69
MESP2-201ENST00000341735 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.05■■■■□ 3.68
MESP2-201ENST00000341735 TOPBP1Q92547 1522 aa38.05■■■■□ 3.68
MESP2-201ENST00000341735 CUX2O14529 1486 aa38.01■■■■□ 3.68
MESP2-201ENST00000341735 CUX1P39880 1505 aa37.99■■■■□ 3.67
MESP2-201ENST00000341735 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.98■■■■□ 3.67
MESP2-201ENST00000341735 SYNJ1O43426 1573 aa37.85■■■■□ 3.65
MESP2-201ENST00000341735 TOP2BQ02880 1626 aa37.82■■■■□ 3.65
MESP2-201ENST00000341735 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.82■■■■□ 3.64
MESP2-201ENST00000341735 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.77■■■■□ 3.64
MESP2-201ENST00000341735 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
MESP2-201ENST00000341735 IFT140Q96RY7 1462 aa37.66■■■■□ 3.62
MESP2-201ENST00000341735 SOGA1O94964 1423 aa37.64■■■■□ 3.62
MESP2-201ENST00000341735 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.61■■■■□ 3.61
MESP2-201ENST00000341735 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
MESP2-201ENST00000341735 TRIM41Q8WV44 630 aa37.53■■■■□ 3.6
MESP2-201ENST00000341735 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.46■■■■□ 3.59
MESP2-201ENST00000341735 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
MESP2-201ENST00000341735 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.43■■■■□ 3.58
MESP2-201ENST00000341735 WDR97A6NE52 1622 aa37.42■■■■□ 3.58
MESP2-201ENST00000341735 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
MESP2-201ENST00000341735 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.33■■■■□ 3.57
MESP2-201ENST00000341735 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.57
MESP2-201ENST00000341735 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.23■■■■□ 3.55
MESP2-201ENST00000341735 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.21■■■■□ 3.55
MESP2-201ENST00000341735 KIF27Q86VH2 1401 aa37.14■■■■□ 3.54
MESP2-201ENST00000341735 GRIN2BQ13224 1484 aa37.11■■■■□ 3.53
MESP2-201ENST00000341735 PBRM1Q86U86 1689 aa37.1■■■■□ 3.53
MESP2-201ENST00000341735 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37■■■■□ 3.51
MESP2-201ENST00000341735 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.99■■■■□ 3.51
MESP2-201ENST00000341735 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.98■■■■□ 3.51
MESP2-201ENST00000341735 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
MESP2-201ENST00000341735 IGF1RP08069 1367 aa36.92■■■■□ 3.5
MESP2-201ENST00000341735 EEA1Q15075 1411 aa36.82■■■■□ 3.49
MESP2-201ENST00000341735 ADAMTS12P58397 1594 aa36.82■■■■□ 3.49
MESP2-201ENST00000341735 SYNJ2O15056 1496 aa36.8■■■■□ 3.48
MESP2-201ENST00000341735 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.8■■■■□ 3.48
MESP2-201ENST00000341735 FBLN2P98095 1184 aa36.78■■■■□ 3.48
MESP2-201ENST00000341735 CUL7Q14999 1698 aa36.78■■■■□ 3.48
MESP2-201ENST00000341735 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
MESP2-201ENST00000341735 CHD1O14646 1710 aa36.76■■■■□ 3.48
MESP2-201ENST00000341735 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
MESP2-201ENST00000341735 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.72■■■■□ 3.47
MESP2-201ENST00000341735 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.71■■■■□ 3.47
MESP2-201ENST00000341735 GRIN2AQ12879 1464 aa36.64■■■■□ 3.46
MESP2-201ENST00000341735 OSCARQ8IYS5 282 aa36.59■■■■□ 3.45
MESP2-201ENST00000341735 PRXQ9BXM0 1461 aa36.57■■■■□ 3.44
MESP2-201ENST00000341735 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.56■■■■□ 3.44
MESP2-201ENST00000341735 NUP160Q12769 1436 aa36.44■■■■□ 3.42
MESP2-201ENST00000341735 CEP170Q5SW79 1584 aa36.43■■■■□ 3.42
MESP2-201ENST00000341735 KIF21BO75037 1637 aa36.4■■■■□ 3.42
MESP2-201ENST00000341735 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.34■■■■□ 3.41
MESP2-201ENST00000341735 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.25■■■■□ 3.39
MESP2-201ENST00000341735 GOLGA3Q08378 1498 aa36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms