Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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