Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BPBP20851 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms